Sea Shepherd beroept zich bij haar acties, daar waar bevoegde autoriteiten het nalaten, op het handhaven van internationale wetten en verdragen voor natuurbehoud. Het belangrijkste mandaat vormt het VN-handvest United Nations World Charter for Nature.
Sea Shepherd zet zich onafhankelijk in voor het handhaven van internationale wetten en verdragen en opereert zonder vooroordelen ten aanzien van ras, huidskleur, nationaliteit of geloofsovertuiging.